管理体制

工程研究中心设立管理委员会和技术委员会，实行管理委员会领导下的主任负责制。下设管理委员会、技术委员会、综合办公室、产业化部等部门。管理委员会是工程中心的决策机构，负责审议中心建设与发展的重大事项，负责制定有关发展方向、规划计划；监督和审查财务预决算；协调相关合作单位间的关系。

工程研究中心实行主任负责制，承担日常研发管理工作，拟订内部管理机构设置方案；提请聘任或解除工程中心以外的管理人员，对有关工作人员聘任、奖惩，组织实施工程中心建设方案；组织实施年度工作计划和研究方案；协调工程研究中心与合作单位的关系等。

工程研究中心技术委员会是工程中心的技术咨询机构，其职责是负责审议工程中心发展战略、研究开发计划，评价工程设计与实验方案，提供技术经济咨询和市场信息，审议工程中心的年度、近中期工作目标等。

综合办公室负责全中心人事、党务、文档等综合事务性工作，协调内外部相关事务，负责中心财务管理和经营核算，制定中心财务计划，安排预算方案，监督检查各部门预算执行情况，定期进行财务分析，向领导汇报中心财务管理情况，发挥领导的参谋助手作用。功能室部主要负责研发课题的立项、实施、管理、宣传及协助中心领导开展项目进展调查、项目监督。产业化部负责人主要负责与企业的沟通联络工作，进行科研、产业化对接。重庆环球石化公司、重庆利农一把手公司等主要进行新品种的中试实验和产业化筹划等工作。

运行机制

为使工程中心建设工作有序进行，从建设开始就积极完善相关制度建设，先后制定了《技术委员会工作章程》、《固定人员管理办法》、《流动人员管理办法》、《研究生管理办法》、《科研数据及研究成法》、《学术活动管理办法》、《科研项目管理办法》、《固定资产管理办法》、《大型仪器设备使用管理办法》、《安全管理办法》、《印章管理办法》、《财务管理办法》等章程，其他制度采用建设单位现行规章制度，总体管理规范、运行有序。